【病毒檢測報告】病毒檢測的那些事兒

時間：2021-06-01

作者：廣東省華微檢測股份有限公司

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詞條
詞條說明
NGS在病原微生物檢測的中的應用
NGS在病原微生物檢測的中的應用1、感染性疾病病原體的鑒定傳統的檢測方法主要有涂片鏡檢，生化反應和*學檢測等等，但存在周期長、過程復雜以及靈敏度低等特點。PCR技術的出現部分解決了上述的問題，但是難以解決未知微生物檢測的難題。而NGS檢測*對病原體進行分離培養，也不依賴于已知的核酸序列設計引物等，可直接對標本進行測序鑒別，大大縮減建庫時間，提高診斷效率，尤其在未知病原微生物檢測方面有**的
病原微生物是什么
病原微生物是什么引起感染的微生物除了我們經常聽到的細菌和病毒以外，還有真菌、支原體、衣原體、寄生蟲、朊粒等，有些名字很多人可能都沒有聽說過。微生物結構簡單，多為單細胞，甚至沒有細胞結構，需要借助顯微鏡甚至電子顯微鏡才能看見它們。自然界中微生物種類**過10萬，大部分對人和動植物有益。如空氣中的氮氣靠微生物作用才能被植物吸收，水中的廢物要靠微生物分解轉化，魚兒才能生存。在農業、食品、制藥、紡織、石油、
流感病毒肺炎流行特征
流感病毒肺炎流行特征1）流感病毒是成人病毒性肺炎中較常見的病毒，健康成年人占4%—8%，在流行期占10%—20%，在大流行期可高達50%。2）到2010年2月，WHO報道**至少16226例由于甲型流感導致的死亡病例，H5N1高致病禽流感的病死率59%，發病到死亡的平均時間為9天，死亡患者大多數沒有基礎疾病。3）傳播途徑：主要通過飛沫經呼吸道傳播，也可通過口腔、鼻腔、眼睛等處黏膜直接或間接接觸傳播
NGS在應用中面臨的主要挑戰
NGS在應用中面臨的主要挑戰雖然NGS在病原微生物的檢測中有著明顯的優勢，但是也依然面臨不少挑戰：1、參考數據庫的完整性。微生物檢測鑒定的準確性很大程度上取決于參考數據庫的范圍與完整性；2、臨床標本的復雜性。臨床標本來源復雜多樣，可能存在病原體信息太少而導致數據丟失或病原體數據混雜在正常菌群中難以區分;3、NGS測序技術的局限性。目前的分析質量依賴于測序質量、基因組組裝的質量以及參考基因組序列的選